사무처 당직자들이 합당에 불편함을 느끼는 가장 큰 이유는 충분한 내부 의견 수렴 없이 공개적으로 제안이 이뤄졌다는 절차적 문제다. 이는 소속 의원들도 문제로 삼고 있으며 정 대표에게 숙의 과정을 거쳐야 한다고 요구하고 있다.

합당에 따른 실질적인 불이익 가능성 역시 핵심 쟁점으로 꼽힌다. 정당은 정치적 결사체이지만, 사무처 당직자들은 공식 채용 절차를 거친 노동자들이기도 하다. 합당이 이뤄질 경우 혁신당 당직자들에 대한 고용 승계가 진행될 가능성이 크고, 이에 따라 인력 예산과 인사 체계 전반에 부담이 커질 수 있다는 우려가 나온다.

타 원내 정당의 한 당직자는 "각 정당이 추구하는 이념이 있기 때문에 정치적인 문제가 우선 크다"면서도 "현실적으론 인력 비용에 대한 당의 1년 예산이 있는데, 인력이 늘어나면 부담이 늘어날 것이고 연봉·상여금 등 경제적인 부분에 영향을 미칠 수 있다는 당연한 우려가 나올 수밖에 없다"고 설명했다.

또한 "혁신당은 창당된 지 2년밖에 안 됐는데, 같은 과장급 직책이라고 해도 민주당과 혁신당 과장의 연차는 다를 수 있다"며 "혁신당에서 과장이라도 해서 민주당에서도 과장 직책을 달아야 한다면 어느 누가 동의할 수 있겠느냐. 특히 이 부분은 결국 경제적인 문제이기도 하다"고 했다.