윤문거(尹文擧, 1606년 ~ 1672년)는 조선의 학자이다. 자는 여망, 호는 석호이며 본관은 파평이다. 윤증의 백부이고 우계 성혼의 외손자이다.

인조 때 문과에 급제하여 정언, 부수찬 등을 지냈다. 병자호란(1636년) 때 아버지 윤황을 따라 왕을 남한산성으로 모셨다. 승지, 이조참의, 대사간, 부제학, 대사헌, 이조참판 등을 지냈다. 그는 글씨에 뛰어났으며, 죽은 뒤 좌찬성에 추증되었다. 저서로는 《석호집》이 있다. 노성(魯城)의 노강서원(魯岡書院), 석성(石城)의 봉호서원(蓬湖書院) 등에 제향되었다. 시호는 충경(忠敬)이다.

논산 노성면일대가 파평윤씨 집성촌임

** 이 사람의 서손 직계가 윤석열